Genòmica Evolutiva

Coordinador:
Antoni Romeu i Santiago Garcia
Dates:
del 27 de juny a l'1 de juliol (30 hores, 3 crèdits)
Lloc:

Les sessions de 9.30 a 11 hores es faran a l' aula 003 de la FACULTAT DE QUÍMICA, c/Marcel.lí Domingo, s/n TARRAGONA.

Les sessions d'11.30 a 13 hores i de 16 a 19 hores es faran a l'aula DEIM3 de l'ETSE, Avinguda Països Catalans, 26 TARRAGONA.

 
Crèdits:
3 crèdits
Preu matrícula:
147 €
Codi curs:
600199

Objectius

El curs té com a objectius introduir les principals eines biocomputacionals de què es disposen per analitzar un genoma complet i extreure’n la màxima informació.


Les ciències de la vida han entrat en el que s'anomena l’era de la genòmica. Des de la seqüenciació del primer genoma complet d'un ésser viu, l'any 1995, s'han seqüenciat més de 150 genomes, entre els quals el genoma humà. La disponibilitat de la seqüència d'aquests genomes tindrà indubtablement una repercussió en àrees tan diverses com la biomedicina o la bioètica. El curs proposat pretén explicar a un públic no especialitzat els temes següents, entre altres: com s’obté la seqüència d’un genoma complet?, quina informació es pot extreure d'aquests genomes? com es poden comparar amb la informació ja disponible? Per fer-ho, s'introduiran les eines bioinformàtiques actualment disponibles i els entorns (com el sistema operatiu Linux i el llenguatge de programació Perl) que permeten la utilització d'aquestes eines.


Continguts

Dilluns 27 de juny
9.30 - 10.30 h

“Organització genòmica ”
Dr. Antoni Romeu, professor titular del Departament de Bioquímica i Biotecnologia de la URV
 
11 - 13 h
“Eines per l'anàlisi de seqüències i construcció filogenètica”
Dr. Carles Aliagas, professor del Departament d'Enginyeria Informàtica i Matemàtiques de la URV
 
16 - 19 h

Cas pràctic I: “Eines per a la cerca en les bases de dades de seqüències d'àcids nucleics i proteïnes”
Sr. Josep Maria Orellana, becari de col·laboració al Departament de Bioquímica i Biotecnologia de la URV
 

Dimarts 28 de juny
9.30 - 11 h
“Caracterització de genomes complets”
Dr. Santiago Garcia Vallvé, professor titular del Departament de Bioquímica i Biotecnologia de la URV
 
11.30 - 13 h
“Perl bàsic”
Sr. Albert Pallejà, becari predoctoral del Departament de Bioquímica i Biotecnologia de la URV
 
16 - 19 h
Cas pràctic II: “Cerca i caracterització de gens d'un plasmidi”
Sr. Albert Pallejà, becari predoctoral del Departament de Bioquímica i Biotecnologia de la URV
 
Dimecres 29 de juny
9.30 - 11 h “Organitzacio genòmica”
Sr. Eduard Guzman, professor associat del Departament de Bioquímica i Biotecnologia de la URV
   
11.30 - 13 h “Perl bàsic II”
Dr. Santiago Garcia Vallvé, professor titular del departament de Bioquímica i Biotecnologia de la URV
   
16 - 19 h Cas pràctic III: “Predicció de l'origen de replicació d'un genoma procariota”
Sr. Albert Pallejà, becari predoctoral del Departament de Bioquímica i Biotecnologia de la URV
   
Dijous 30 de juny
9.30 - 11 h “Evolució molecular”
Dr. Antoni Romeu, professor titular del Departament de Bioquímica i Biotecnologia de la URV
   
11.30 - 13 h “Eines per l'anàlisi de seqüències i construccuó filogenètica”
Sr. Pere Puigbò, becari predoctoral del Departament de Bioquímica i Biotecnologia de la URV
   
16 - 19 h Cas pràctic IV: “Construcció d'un arbre filogenètic”
Sr. Pere Puigbò, becari predoctoral del Departament de Bioquímica i Biotecnologia de la URV
   
Divendres 1 de juliol
9.30 - 11 h “Genòmica i metabolisme”
Dr. Miguel Ángel Montero, professor associat del Departament de Bioquímica i Biotecnologia de la URV
   
11.30 - 13 h “Bases de dades d'informació metabòlica”
Dr. Miguel Ángel Montero, professor associat del Departament de Bioquímica i Biotecnologia de la URV
   
16 - 19 h Cas pràctic V: “Cerca de rutes metabòliques codificades en un genoma”
Sra. Marina Marcet, becària de col·laboració al Departament de Bioquímica i Biotecnologia de la URV